NVIDIA·구글 딥마인드, 바이러스 단백질 구조 2800종 공개
NVIDIA가 Google DeepMind, EMBL-EBI 등 국제 연구기관들과 함께 2,800종 이상 바이러스의 단백질 복합체 3D 예측 구조를 알파폴드 데이터베이스(AlphaFold Database)에 공개했다. 이 구조는 Google DeepMind의 AlphaFold2를 NVIDIA BioNeMo 추론 런타임으로 최적화해 대량 예측한 것이며, NVIDIA는 이 작업에 쓰인 GPU 가속 워크플로 BioNeMo Structure Prediction Pipeline도 함께 공개해 다른 연구자들도 자신의 단백질 서열을 구조 예측에 활용할 수 있게 했다. 새로 추가된 단백질 상호작용의 약 30%는 기존 단백질 데이터뱅크(PDB)에 없던 새로운 형태다. 이번 발표는 뉴욕에서 열린 유엔총회 팬데믹 대비 관련 회의 기간에 맞춰 이뤄졌으며, 코로나19 대유행처럼 사전 지식 없이 새 바이러스가 출현할 경우를 대비한 것이라고 프로젝트 참여 연구자들은 설명했다.